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具体来看，衢州共有陆生高等植物3163种、哺乳动物63种、鸟类355种、两栖动物42种、爬行动物78种、昆虫4542种、淡水鱼类166种、大型真菌1027种；共记录国家重点保护野生动植物147种，受威胁物种123种，浙江省重点保护野生动植物131种，其中包括南方红豆杉、黑麂、白颈长尾雉、黄腹角雉等国家一级保护野生动植物17种，伯乐树、亚洲黑熊、仙八色鸫、阳彩臂金龟等国家二级保护野生动植物130种。
衢州市生态环境局局长钟战铁介绍，2019年起，衢州全面启动了生物多样性本底调查，是全国较早开展重点区域生物多样性调查评估的地区。截至目前，衢州两区一市三县已基本完成本底调查，摸清生物多样性家底，掌握了重点保护物种和珍稀濒危物种分布状况，建立起该市生物多样性本底数据库。
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