针对探索根本性科学问题的需要，李政道研究所建设了位于上海张江大本营的具有特殊功能的三个专用研究平台，以及具有极限探测能力的三大前进观测基地，包括实验室天体物理实验平台，拓扑量子计算实验平台，大规模科学计算平台，位于四川锦屏的深地PandaX暗物质与中微子探测装置，建设在海南南海3500米深海处的海铃中微子望远镜（TRIDENT）和建设在青海冷湖4300米海拔处JUST光谱望远镜。在持续开展高水平自由探索研究的基础上，依托三大研究平台和三个前进观测基地，充分发挥大科学装置的优势，以联合攻关的方式开展有组织的科学研究。近年来，在粒子与核物理、天文与天体物理、量子基础科学三大方向上围绕李政道研究所的根本性科问题取得了一系列重要进展和重大突破。
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