在复旦20多年，赵东元团结了一批年轻人，注重科研梯队建设。他所带的团队，有一个不成文的规定，每次赵院士获奖拿到的奖金，有20%-30%用来资助年轻学者发展。他所培养的研究生，有3人获得“全国优秀博士学位论文”，3人获得“全国优秀博士学位论文”提名奖，10人获得上海市研究生优秀成果（学位论文），6人获得复旦大学“优秀博士后”称号，12人获得上海市研究生优秀成果（学位论文）。
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